丘祖洞（长春洞、祖师洞） 洞在七真楼后悬崖上，与定心峰成子午中直线。援木梯铁链登高约4米即达。洞高近2米，深约3米，为丘处机修道之处。洞内有丘处机遗物磨性石，并祀有丘处机坐像，洞上刻有“长春洞”三字，此洞虽小，但为全真道龙门派祖师的潜修处，游人尤其是全真道徒到此，必油然而生“高山仰止”之感，“见洛河乃思禹迹”（重修龙门洞碑记语）之崇古幽情，诚心顶礼，虔诚以拜。

混元洞 位于龙门山灵仙崖宽阔绝壁凹入部位的顶端，海拔1800米，为龙门山最高洞穴。其下和左右两边分布着众多岩洞。前代道士自道院后引径至半山处开凿石阶，架铁链。云梯。天桥，垂直而上，将其在主要深洞上构建的殿宇亭阁沟通，构造极尽鬼斧神工。达此洞需经半山救苦殿攀铁链经太上殿至太白殿，再由太白殿过天桥到玉皇殿，再由玉皇殿沿铁链木梯到三清阁，再攀云梯方至。栈道云梯凌空飞越，高入云端，攀登十分艰险。在混元顶坐洞瞩目，远近山峦秀色尽收眼帘，浮云飘渺，心旷神怡，犹入仙境。虽群山巍峨，但由于居高临下，“一览众山小”之感顿生。

太玄洞（日月洞） 位于混元顶左下侧，洞左侧面向西北的绝壁上竖刻有“定日月娄景先生洞”8字，每字大约1米见方。传为娄景栖居处，后又有唐孙思邈于此洞隐栖。

丹阳洞 在邱祖洞右下侧，为丹阳真人马钰修道处。此洞极窄狭，仅可容身。重阳真人仙逝后，丘以马维师，所以马与丘既师既友；同时，丘来陇是马的安排，因而两人的栖居洞府相连在一起。据传，连两人打坐的蒲团也同为一个，分丹也各为一半，在全真教内传为佳话。

烟霞洞 在邱祖洞右下方道院云厨后，深约6米。金元时，丘处机弟子赵九古等曾栖修于此洞，至元（1264-1294）后，来龙门洞的游方道人多栖于此。现用为道院云厨库房。

会贞洞（春花洞、百子洞） 在子孙宫后，由道院西侧门可入，洞深约3米，宽敞洁净，冬暖夏凉。传为金元时丘处机的女弟子李春花（不二）的栖居处，故又名春花洞。又因在子孙宫后，亦名百子洞。

白云洞 在子孙宫北侧10多米的悬崖上，数洞相连，俯临峡谷，朝夕常有雾弥漫，景象多幻，昔为道众吟诗栖修处。清同治年间动乱，乡人避难多于此藏身。

晚霞洞（晚阳洞） 在白云洞下绝壁间，有石蹬栈道曲折相通。洞口面西稍北，较晚见阳光故名。洞内存有前代修道者用过的石床、丹台等物。

三仙洞  在龙门山三仙阁左下，通道有两条：由黑虎殿后小道北上，过石山门再上即至；或由道院经子孙宫，过晚霞洞再上可达。此洞高阔盈丈，洞中有石床、石凳，均为天然物。传为“八仙”中的钟离权、吕洞宾、韩湘子的栖居传道处。

雷祖洞 由三仙洞攀缘木梯铁链10余米即到。洞口高、宽近3米，深6米。洞内多钟乳岩，肖似人形，晶莹雪白，光亮鉴人。洞中央木龛上供有明代的木雕雷祖像，神态威猛，现移置于北极殿。洞外有古楼凌空伸出，曲俯如虬。因地处险峻，游人多望而却步。

朝元洞（湘子洞、连环洞） 在龙门山北湘子湾。此间山势陡峭，怪石嶙峋，峭壁半圈如屏，因洞东、北、西三面各有洞口，故又称连环洞，南侧洞口甚大，洞内宽敞，可容百人。洞中怪石众多，洞顶蝙蝠聚栖，洞底厚积蝙蝠粪便，此粪入药名夜明砂。此间森煞阴冷，令人踟蹰却步。东洞口传为韩湘子所居，故亦名湘子洞。洞西石庭为羽士所居，庭北平坦处设有木床，临床有口如窗，由其鸟瞰山下，水鸣山啸，气象万千。

谷神洞  在湘子洞北20余米处，洞口靠近道院山庄，地势平缓，故取《道德经》谷神不死之意而名，预兆庄稼丰收，五谷丰登。

洞中洞（洞内洞）在朝元洞石坎下，洞口高近2米，内深5米，形如瓮。。洞内侧北向又有一洞，深不可测，相传多怪异。1947年夏，有蜀中道士十余人，与龙门洞道院道士张嗣凯、阎兴隆等结伴往探，持松明火把缘梯垂索，下至数十丈（1丈为3.3米多）时，见两壁钟乳石晶莹闪烁，亦有火光人影蹑步迎面而来，道众惊骇而返。数月后，又有巨蛇盘曲于道院云厨中，道众焚香祈祷，其蛇潜入此洞中，后未复见。

朱砂洞  在山核桃滩（又名山河滩）东断壁下，高、宽1米多，深7米，内多赤石，乡人视为朱砂，多采为药用，并传有效。

禹王洞 在蹑云桥东崖畔，洞口高3米，宽2米，深2米。前庭南侧有水槽，偶有水流下泻。其下为禹王庙遗址，相传大禹治水时曾驻足此洞。

水帘洞 在禹王洞右上方10米处，有石蹬通达，洞口高、宽约7米，深约30余米，洞内多钟乳石。有小罅与后山庄房门前水池隧通，相距约3公里，池水多由洞内渗出。旧相传池中之物曾随水泻出，今因通道淤塞，仅有少量渗水。

黑虎洞 在黑虎洞与黑虎潭间的悬崖上，与早阳洞隔涧相望，由黑虎潭边攀壁可到，深约4米，宽约10米。站在此处，可仰看山峦浮云飘逸，俯视涧底惊涛沸腾。

青霞洞 在由黑虎殿去道院的路旁，深涧3米多，于洞内可观定心峰。相传明时道人陈明耀、张三丰曾栖居此洞。

丹霞洞 在青霞洞左上，可拾级而上至洞口。洞深3-4米，背风向阳，洞顶有口如天窗，常有道士栖居。

卧云洞 在丹霞洞左侧斜上20多米的石壁上，宽7米，高3米。下林深涧，常有云雾。

龙门洞  在北极宫大殿的南基阶下。洞口宽近3米，不知其深，传说北通崆峒山。清康熙初修建北极宫时将其封闭，镇以绘有盘龙图案及“秀水”二字的石板。1949年重修此殿时曾掘开洞口，因洞内冷风袭面，人不敢入，遂原封其口至今。

飞仙洞 在台上殿左侧天桥石壁上， 相传系南唐时谭峭弟子赵飞仙栖居之处。早已坍塌。

列仙洞  在王母宫右下峭壁上。下临深渊，无路可及。洞小，仅能容一人打坐。相传东周时列御寇曾住过此洞。

玉皇洞  在玉皇阁后石壁上。由玉皇阁内沿木梯攀壁而上数步，有石壁高近3米，再引索而登即是。洞高、阔3米余，洞内钟乳石多姿，并有洞左右相通，俗传深不可测，可通平凉崆峒山。洞内有凌空梯链可上达三清洞。

蜜蜂洞  在三清阁右上侧绝壁上，洞口不足1米，无路可通，不知其深。夏秋季节，有成群蜜蜂出入洞口，弥漫灵台。

娄景洞  在混元顶右侧，在诸洞中位置最高，相传为汉娄景先生炼丹之所。

八仙洞  在药王殿后石崖间。洞口矮扁，沿洞俯行数步即有巨石挡道，侧身挤入后，或宽或窄，或高或低，钟乳石遍布，深不确知。传有刘姓道人自述，曾在洞中摸索三日，抵达

玉皇洞，孰真孰假，未有人再进可证。

莲花洞  在定心峰左下悬崖间。  由灵官殿下小道可通往。洞顶钟乳石呈莲花状，故名。旧时常有游方道人栖止洞中。

心珠洞  在定心峰顶侧，洞口近2米，深约7米，可供道士栖止。

青霓洞  位于去早阳洞的栈道北端石崖下。洞口扁形，宽3米余。洞内多巨石堆积，形态奇异，甚为难行，狭矮处需躬身侧进。曲俯而下，深不可知，游人进入数米即止，并隐约可闻水声。洞口四季常有雾涌出，遇阳光折射，五光十色，煞是壮观，故名。

早阳洞 位于龙门峡西朝元峰悬崖上。洞有3孔。主洞高6米，宽5米，深8米。上方有小洞为通气之窗。洞有两窟，内外相连。外洞口镶楹檐为屋，为祀奉药王孙思邈之龛洞，内洞阴湿沁冷，人不常入。因洞口面向东南，太阳能最先照入而名。此洞位于峭壁之上，下临深渊，洞壁北沿崖架有栈桥铁链，长36米，游人缘此可至洞前。俯视洞下，杳不见底，只闻峡谷中湍流轰鸣，冷风呼号，令人恐惧。清乾隆年间（1736-1795），甘肃靖远县道士陈明耀（野仙）曾隐修此洞，行医募化，整修庙宇。石壁上刻有陈明耀诗句：“身居早阳洞，云游遇仙桥”。后道士刘一明来龙门洞，曾赋诗七绝一首咏此洞景象：百丈悬崖斧削同，危桥一通在虚空，若无大道真仙手，当面问天路不通。“足见此洞奇险。

范阳洞（范爷洞） 从蹑云桥头西循朝元山麓，有小道沿早阳洞巅南行，跋涉约百米再下折即至。其洞与早阳洞间岩而并列于绝壁上。洞内分上下两层，下洞深3米余，有木梯和蜿蜒隧道可通上洞，上下洞南北壁间凿有窗洞采光。洞中复有小洞，深阔2-3米，有泉如盆，清澈甘洌，四季不涸。清初有道士范宗理栖此，时称范爷洞，后讹称范阳洞。

迎阳洞  在范阳洞南约百米的崖壁上，因洞面东向而名。

烟雾洞 在朝元峰九沟湾下绝壁上，洞口约3米，自龙门洞道院可远眺洞口，人迹罕至。夏秋雨前有云雾缭绕，弥漫崖涧。

养心洞 位于邱祖洞北石壁上，高宽仅1米余，深约3米，可容人侧身出入。因其地幽僻，洞口亦隐僻，为道士静养地，故少人迹。